КОРОНА ВИРУС И ЊЕГОВЕ МУТАЦИЈЕ: Који све нови сојеви постоје и да ли ће вакцине утицати на њих?
Мутације представљају природну последицу код репликације вируса.
Недавни наслов објављен у часопису ЈАМА, у којем се наводи да су се током пандемије корона вируса појавиле мутације вируса које су привукле пажњу медија, изазвао је различите реакције научне заједнице, а владе су позивале грађане на смиреност.
И док су научници били скептични према новој мутацији попут Д614Г и њеном значају, појавила се још једна мутација Б.1.1.7 која је изазвала велику забринутост.
Проучавање нових варијанти вируса захтева разумевање еволуције и генетске или молекуларне епидемиологије САРС-ЦоВ-2.
ПООШТРЕНЕ МЕРЕ НА ГРАНИЦАМА ОД ПЕТКА: Аустрија поново појачава рестрикције, за кога ће важити стожи режим?
БРОЈКЕ НИКАКО ДА СЕ ЗАУСТАВЕ: Од корона вируса у свету оболео 91 милион људи
Мутације, вирусни сојеви и ширење
Мутације настају као природна последица репликације вируса. РНК вируси обично мутирају више од ДНК вируса, али корона вируси имају мање мутација од већине РНК вируса јер имају корективне механизме у свом генетском материјалу.
Вероватно ће преовладавати мутације које дају предност вирусној репликацији, преношењу или изостанку имунолошког одговора домаћина, док вируси са оштећеним мутацијама имају тенденцију да се елиминишу из популације вирусних сојева.
Ефикасност вакцине
Поставља се питање, да ли мутације спољашњег гликопротеина могу избећи имуни одговор или чак угрозити ефикасност вакцина. Тренутно се избор сојева са специфичним мутацијама не може водити имунолошким одговором домаћина, јер је особа које су развиле имунитет врло мало.
Супротно томе, ако вирус има једну или више мутација које повећавају инфективност, он би могао доминирати. Будући да тренутне вакцине изазивају имуни одговор кроз спољни гликопротеин, вероватно је да се може постићи ефикасна заштита упркос мутацијама САРС-ЦоВ-2.
Први поступак је "природна селекција". На пример, "оснивачки феномен" се дешава када ограничен број појединачних вируса успостави нову популацију током преноса.
Мутације у геному ових вируса доминираће случајно без обзира на њихове биолошке карактеристике. Интеракција између природне селекције и случајних догађаја обликује еволуцију вируса унутар домаћина, у заједницама и на ширим географским подручјима.
Иако се појмови мутације, варијанте и соја често користе наизменично за описивање епидемиологије САРС-ЦоВ-2, разлике су значајне. Мутација се односи на замену у генетском материјалу или протеину вируса: Д614Г је замена на положају 614 спољног гликопротеина.
Вирусни геноми који имају ову мутацију окарактерисани су као варијанте. Овај термин је, међутим, мање тачан јер се 2 варијанте могу разликовати за 1 или више мутација. Обично се позивамо на варијанту када сој има другачији фенотип (нпр. разлике у антигености, преносивости или заразности).
Д614Г
Мутација Д614Г у спољном гликопротеину САРС-ЦоВ-2 први пут је идентификована почетком марта 2020. године и проширила се широм света у наредних месец дана.
У почетку се сматрало да се мутација догодила независно у различитим регионима, али је потом Д614Г такође откривен у сојевима у неколико делова Кине крајем јануара 2020. То објашњава зашто би глобално ширење ове мутације могло бити последица случајних "оснивачких појава" , у којем су изворни вируси који се преносе у већини делова имали Д614Г.
Ова веродостојна хипотеза навела је многе на сумњу да је мутација Д614Г пружила предност, упркос ин витро подацима који показују да се вирус Д614Г ефикасније везује за рецептор.
Н453И
САРС-ЦоВ-2 откривен је на фармама куна у Холандији и Данској крајем пролећа и почетком лета 2020. Истраживање је показало да може доћи до преноса са човека на животињу и обрнуто. Почетком новембра 2020. данске власти пријавиле су 214 случајева на фарми куна.
Многе секвенце САРС-ЦоВ-2 из Холандије и Данске имале су мутацију И453Ф на спољашњем месту везивања протеина за рецептор. Ова мутација појачава интеракцију са рецепторима куне. Утврђено је да вирус од једанаест јединки у Данској има варијанту идентификовану као група 5, која укључује 3 додатне мутације (делеција 69-70, И692В и М1229И).
Пролиферација САРС-ЦоВ-2 је била алармантна, јер би континуирана еволуција вируса на животињама потенцијално могла довести до нових сојева са непознатим карактеристикама који би се могли пренети на људе и друге сисаре. Из тог разлога, многе земље су извршиле масовна уништења куна на фармама.
Група Б.1.1.7 и Н501И
Група Б.1.1.7 (такође названа 501И.В1) брзо се шири на југоистоку Енглеске. Ова група је идентификована у септембру 2020. године и укључује 17 мутација, што указује на значајан ранији развој, вероватно код особе са дугим периодом инфекције.
Од 28. децембра 2020. године ова група чини око 28% инфекција у Великој Британији, а популацијски модели процењују да се 56% ефикасније шири од осталих вируса. За разлику од Д614Г, који је случајно пренесен, група Б.1.1.7 је почела да се преноси када је већ повећан пренос различитих сојева у заједници. То указује на могућност да је ова група заразнија на нивоу популације.